در دوران مبارزات پانزدهساله نیز حوزههای علمیّهی قم و دیگر حوزههای علمیّه و چهرههای سرشناس روحانیّت، کانونهای اصلی مبارزه و بالطّبع هدفهای اصلی حملات وحشیانهی دشمن بودند؛ لیکن این شدّتعملهای بیحدوحساب، به ارادهی الهی، موجب آن نشد که روحانیّت از راه پُرافتخار خود که پیمودن آن، وظیفهی تخلّفناپذیر اسلامی او بود قدم باز پس نهد بلکه در این دوران، فکر اسلامی شکوفاتر و صیقلخوردهتر، و فقه قرآن پُربارتر، و شخصیّت روحانیّون مبارز آبدیدهتر شد و زمینه برای تشکیل حکومت اسلامی فراهم آمد.